上市公司在收到证监会或交易所的问询函后，如果未能在规定时间内回复，可能会多次申请延期。从搜索结果来看，并没有统一的规定限制上市公司延期回复的次数。然而，频繁的延期回复可能会引起监管机构的进一步关注和质疑。
对于延期回复问询函的上市公司，可能会面临以下几种后果：
1. 监管关注和问询：如果上市公司未能及时回复问询函，监管机构可能会发出更多的关注函或问询函，要求公司解释延期的原因。
2. 监管措施：根据《上市公司信息披露管理办法》，如果上市公司未按规定履行信息披露义务，证监会可以采取责令改正、监管谈话、出具警示函等监管措施。
3. 纪律处分：交易所可能会对未及时回复问询函的上市公司采取纪律处分，这可能包括公开谴责、限制交易等。
4. 法律风险：如果上市公司的延期回复行为涉嫌虚假陈述或信息披露违规，可能会面临法律风险，包括行政处罚和投资者的索赔诉讼。
5. 市场影响：延期回复可能会影响投资者对公司的信心，导致股价波动，进而影响公司的市场形象和融资能力。
6. 退市风险：特别是对于已经处于退市风险警示状态的ST或*ST公司，如果未能及时回复问询函并解决相关问题，可能会增加退市的风险。
综上所述，上市公司应当重视监管机构的问询函，并及时、准确地进行回复，以免引发不必要的监管风险和市场负面影响。同时，监管机构也在不断完善相关规则，以提高上市公司信息披露的质量和效率。